Web Host Manager (WHM) ist eine Anwendung, die administrative Kontrolle über Ihren VPS oder dedizierten Server ermöglicht. In WHM erstellen Sie einzelne cPanel-Konten, fügen Domains hinzu oder entfernen sie und verwalten Funktionen im Zusammenhang mit dem E-Mail-Server, MySQL-Server oder Apache-Webserver. Vollzugriff auf WHM erhalten nur Server- oder VPS-Administratoren. Reseller haben eingeschränkten Zugang zu WHM.
cPanel ist das Site-Management-Panel, in dem jeder Kontoinhaber seine spezifischen Einstellungen steuert. Das Erstellen von E-Mail-Konten, die Verwaltung von Datenbanken und MySQL-Benutzern, der Zugriff auf verschiedene Statistiken für eine bestimmte Domain erfolgt beispielsweise in cPanel und nicht in WHM. Alle Hosting-Konten auf einem Server verfügen über cPanel.